Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms