Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATAD3BQ5T9A4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms