Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP170Q5SW79 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms