Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP188Q5SRE5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms