Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms