Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms