Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A12Q504Y0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms