Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC38Q502W7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms