Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms