Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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KRTAP27-1Q3LI81 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KRTAP27-1Q3LI81 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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