Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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KRTAP21-3Q3LHN1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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