Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF3Q3KNV8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCGF3Q3KNV8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms