Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT24Q2M2I5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT24Q2M2I5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms