Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms