Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms