Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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FXNQ16595 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FXNQ16595 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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FXNQ16595 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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