Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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