Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms