Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC23BQ15437 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC23BQ15437 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC23BQ15437 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC23BQ15437 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SEC23BQ15437 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SEC23BQ15437 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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