Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
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