Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
R3HDM1Q15032 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
R3HDM1Q15032 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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