Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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