Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIN2CQ14957 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIN2CQ14957 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms