Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms