Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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