Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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