Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P3Q13401 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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