Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATMQ13315 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATMQ13315 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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