Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTP4A2Q12974 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTP4A2Q12974 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms