Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.7 ms