Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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EFEMP1Q12805 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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EFEMP1Q12805 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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EFEMP1Q12805 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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EFEMP1Q12805 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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EFEMP1Q12805 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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EFEMP1Q12805 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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EFEMP1Q12805 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFEMP1Q12805 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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