Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GTF3C1Q12789 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GTF3C1Q12789 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GTF3C1Q12789 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF3C1Q12789 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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