Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EP300Q09472 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EP300Q09472 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EP300Q09472 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EP300Q09472 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EP300Q09472 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EP300Q09472 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EP300Q09472 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EP300Q09472 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms