Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GABPB1Q06547 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms