Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CREMQ03060 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CREMQ03060 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CREMQ03060 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CREMQ03060 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREMQ03060 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREMQ03060 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREMQ03060 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms