Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms