Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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H3F3AP84243 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3AP84243 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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