Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB1P82279 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB1P82279 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB1P82279 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRB1P82279 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRB1P82279 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB1P82279 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB1P82279 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB1P82279 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms