Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PITX1P78337 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITX1P78337 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PITX1P78337 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
PITX1P78337 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PITX1P78337 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITX1P78337 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms