Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms