Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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