Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFA1P59665 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms