Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms