Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA9P57773 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA9P57773 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA9P57773 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJA9P57773 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJA9P57773 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJA9P57773 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA9P57773 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms