Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms