Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP6P55212 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP6P55212 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP6P55212 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms