Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC16A1P53985 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms