Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA3P52797 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms