Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB28P51157 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB28P51157 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB28P51157 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms