Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPAP49450 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPAP49450 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms